Karmele Urresti, curandera y defensora de los heridos en su ciudad natal de Ondarroa, se ve sorprendida por la Guerra Civil en España. A medida que la población huye al exilio, Karmele decide quedarse y curar a los heridos mientras intenta liberar a su padre encarcelado. Al final de la guerra, tiene que abandonar su tierra y partir hacia Francia, donde se une a la embajada cultural vasca. Allí, conoce a Txomin Letamendi, su esposo, un músico.
Txomin y Karmele recorren media Europa juntos hasta que, con la amenaza de la toma de París por parte de los alemanes, huyen a Venezuela. Pero la historia vuelve a impactar en su vida cuando Txomin decide unirse a los servicios secretos vascos y la familia regresa a Europa durante la Segunda Guerra Mundial. Txomin trabaja como espía contra los nazis hasta que es capturado en Barcelona bajo una dictadura de la que no sobrevivirá.
Karmele se enfrentará a riesgos y deberá partir sola esta vez, dejando atrás lo más preciado. La hora de despertarnos juntos es una gran novela que aborda la historia vasca, española y europea del siglo XX hasta nuestros días.